Trefwoorden
Bio-informatica en -statistiek
Doelstellingen
In vijf jaar tijd evolueerde bioinformatica van een obscure academische specialisatie naar het sleutelwoord van de 21ste-eeuwse biologie en biotechnologie. Tijdens die periode werd niet alleen de genetische code van de mens, maar ook van een aantal modelorganismen bijna helemaal ontrafeld. Dit genereerde enorme hoeveelheden biologische data die echter nog maar het topje van de ijsberg zijn. DNA-banken worden wereldwijd met RNA- en eiwitdatabanken gelinkt en DNA-chips leveren op korte tijd expressiepatronen en tijdcorrelaties van tienduizenden genen. Met gespecialiseerde softwarepakketten wordt “data-mining” mogelijk: op zoek gaan naar nuttige (patenteerbare) genen en genproducten. Het creëren van nieuwe transgene organismen (landbouw, veeteelt, milieu) en ontwikkelen van nieuwe medicijnen en dieetvoeding wordt hierdoor goedkoper en sneller.
Deze cursus bio-informatica en –statistiek heeft volgende doelstellingen:
· Inzicht verschaffen in de manier waarop DNA, RNA en eiwitdatabanken tot stand komen, georganiseerd en gelinkt worden;
· Sequenties kunnen opzoeken, analyseren, verwerken en kritisch interpreteren
Voorkennis
genetica, biotechnologie, biochemie, informatica
Leerinhoud
- Theorie:
Genoomstructuur van modelorganismen, technologieën voor de analyse van complexe genomen, structuur van de data, keuze van software, achterliggende algoritmen en statistiek, interpretatie van zoek- en verwerkingsresultaten, belangrijke landbouwkundige, medische en farmaceutische toepassingen.
- Oefeningen:
Gebruik van software voor screening, analyse en verwerking van gegevens uit DNA-, RNA- en proteïnedatabanken. Interpretatie computer-outputs. Opsporen en vergelijken van sequenties, linken van DNA met eiwitdatabanken, primerdesign, clusteranalyse,…
Onderwijsvormen
hoorcolleges, groepswerk, practische oefeningen, bedrijfsbezoek
Studiematerialen
syllabus “Bio-informatica”, handleiding oefeningen, PC-lokaal, internet
Studiebegeleiding
Permanent mogelijkheid tot vraagstelling
Beoordeling
Theorie: mondeling examen met schriftelijke voorbereiding
Oefeningen: verslag
Studiekosten
10 €
OP-leden
Stefaan Werbrouck
Taal
Nederlands
|
|
