| Wordt gegeven in |
4de jaar Landbouw en biotechnologie optie landbouw, keuze toegepaste cel- en gentechnologie
4de jaar Landbouw en biotechnologie optie landbouw, keuze toegepaste cel- en gentechnologie
4de jaar Landbouw en biotechnologie optie tuinbouw, keuze toegepaste cel- en gentechnologie
4de jaar Landbouw en biotechnologie optie tuinbouw, keuze toegepaste cel- en gentechnologie
4de jaar Landbouw en biotechnologie optie landbouw- en voedingsindustrieën, keuze toegepaste cel- en gentechnologie
4de jaar Landbouw en biotechnologie optie landbouw- en voedingsindustrieën, keuze toegepaste cel- en gentechnologie
|
| Theorie |
[A] 0.0 |
| Toepassingen |
[B] 25.0 |
| Stages en scriptie |
[C] 25.0 |
| Studietijd |
[D] 90 |
| Studiepunten |
[E] 3 |
| Doceertaal |
Nederlands |
| Titularis |
Stefaan WERBROUCK
|
| Referentie |
BILBIL04K20560 |
|
Trefwoorden
Bio-informatica en -statistiek
Doelstellingen
In vijf jaar tijd evolueerde bioinformatica van een obscure academische specialisatie naar het sleutelwoord van de 21ste-eeuwse biologie en biotechnologie. Tijdens die periode werd niet alleen de genetische code van de mens, maar ook van een aantal modelorganismen bijna helemaal ontrafeld. Dit genereerde enorme hoeveelheden biologische data die echter nog maar het topje van de ijsberg zijn. DNA-banken worden wereldwijd met RNA- en eiwitdatabanken gelinkt en DNA-chips leveren op korte tijd expressiepatronen en tijdcorrelaties van tienduizenden genen. Met gespecialiseerde softwarepakketten wordt “data-mining” mogelijk: op zoek gaan naar nuttige (patenteerbare) genen en genproducten. Het creëren van nieuwe transgene organismen (landbouw, veeteelt, milieu) en ontwikkelen van nieuwe medicijnen en dieetvoeding wordt hierdoor goedkoper en sneller.
Deze cursus bio-informatica en –statistiek streeft volgende competenties na:
- Inzicht verschaffen in de manier waarop DNA, RNA en eiwitdatabanken tot stand komen, georganiseerd en gelinkt worden;
- Sequenties kunnen opzoeken, analyseren en verwerken met software die vrij beschikbaar is op internet en met het WEMBOSS-pakket van de "Belgian EMBNET-NODE""
- Kritisch interpreteren van de door de software gegenereerde resultaten.
Leerinhoud
- Theorie:
Genoomstructuur van modelorganismen, structuur van de data, keuze van software, achterliggende algoritmen en statistiek, interpretatie van zoek- en verwerkingsresultaten
- Oefeningen:
Gebruik van software voor screening, analyse en verwerking van gegevens uit DNA-, RNA- en proteïnedatabanken. Interpretatie computer-outputs. Opsporen en vergelijken van sequenties, linken van DNA met eiwitdatabanken, primerdesign, clusteranalyse,…
Begincompetenties
Genetica, biotechnologie, biochemie, informatica.
Eindcompetenties
Leermaterialen
Syllabus “Bio-informatica”, handleiding oefeningen, PC-lokaal, internet.
Studiekosten
10 €
Studiebegeleiding
Permanent mogelijkheid tot vraagstelling
Onderwijsvormen
Hoorcolleges, projectwerk, practische oefeningen, bedrijfsbezoek.
Evaluatievorm
Theorie: mondeling examen met schriftelijke voorbereiding
Oefeningen: verslag
OP-leden
Stefaan Werbrouck
|
|
