Trefwoorden
T490, B110
Doelstellingen
In vijf jaar tijd evolueerde de bioinformatica van een obscure academische specialisatie naar het sleutelwoord van de 21ste-eeuwse biologie en biotechnologie. Tijdens die periode werd niet alleen de genetische code van de mens, maar ook van een aantal modelorganismen bijna helemaal ontrafeld. Dit genereerde enorme hoeveelheden biologische data die echter nog maar het topje van de ijsberg zijn. DNA-banken worden wereldwijd met RNA- en eiwitdatabanken gelinkt en DNA-chips leveren op korte tijd expressiepatronen en tijdcorrelaties van tienduizenden genen. Met gespecialiseerde softwarepakketten wordt “data-mining” mogelijk: op zoek gaan naar nuttige (patenteerbare) genen en genproducten. Het creëren van nieuwe transgene organismen (landbouw, veeteelt, milieu) en ontwikkelen van nieuwe medicijnen en dieetvoeding wordt hierdoor goedkoper en sneller.
Leerinhoud
In verschillende oefeningenlessen worden korte theoretische toelichtingen afgewisseld met oefeningen. Op het einde van elke oefeningenles krijgen de studenten een oefening die hun vaardigheden die ze tijdens de les hebben opgedaan test. De oefeningen worden opgelost m.b.v. bioinformatica-tools die vrij beschikbaar zijn op het internet. Volgende zaken komen aan bod in de oefeningen:
- Structuur van DNA-, eiwit en andere biologische databanken en het gericht zoeken naar bepaalde sequenties en structuren.
- Het uitvoeren van alignments (pairwise alignment, multiple alignment, BLAST, local alignment, global alignment,…) en het kunnen gebruiken van alignments voor praktische toepassingen.
- Werken met en analyseren van dot plots.
- Digitale kloneringtechnieken m.b.v. restrictieanalyses en primerontwikkeling
- Het analyseren van nucleotide- en eiwitsequenties.
- Het opstellen van fylogenetische bomen.
De oefeningen illustreren bovendien andere biotechnologische vakken en reiken een extra dimensie aan voor het eindwerk.
Begincompetenties
Eindcompetenties verworven voor biochemie, biotechnologie, genetica en informatica.
Eindcompetenties
- Inzicht krijgen in DNA, RNA en eiwitdatabanken, Sequenties kunnen opzoeken, analyseren en verwerken, zoek- en verwerkingsresultaten kunnen interpreteren.
- Een opdracht kunnen analyseren en actief, in functie van een probleem, gepaste tools en randinformatie kunnen kiezen en toepassen.
- Vakoverschrijdend leren denken
Leermaterialen
::Voor meer informatie, klik hier::
Powerpointslides, website bioinformatica, handleidingen softwaretoepassingen, PC-lokaal, internet
Studiekosten
Geraamde totaalprijs: 10.0 EUR
10 EUR
Studiebegeleiding
Permanente mogelijkheid tot vraagstelling, begeleide oefeningen
Onderwijsvormen
Praktische oefeningen in PC-lokaal, oefeningen, bedrijfsbezoek
Evaluatievorm
Verslagen oefeningen
Wegingscoëfficiënt:
2de zittijd: raadpleeg de departementale aanvullingen op de onderwijs- en examenregeling voor de specifieke modaliteiten.
OP-leden
Hans Motte
|
|
